More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1540 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  98.4 
 
 
312 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  91.99 
 
 
311 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  88.37 
 
 
319 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  87.66 
 
 
316 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  89.04 
 
 
316 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  68.24 
 
 
307 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  58.43 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  52.16 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  53.16 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  54.3 
 
 
302 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 
302 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  52 
 
 
302 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  51.83 
 
 
302 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  52.59 
 
 
305 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  52.49 
 
 
302 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  51.49 
 
 
305 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 
302 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  52 
 
 
302 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  52 
 
 
302 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  50 
 
 
284 aa  222  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.57 
 
 
315 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  35.92 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.48 
 
 
306 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.89 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.82 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.35 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.83 
 
 
322 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.03 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  34.59 
 
 
321 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  37.4 
 
 
306 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.68 
 
 
307 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.14 
 
 
306 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.44 
 
 
308 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
312 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.26 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.05 
 
 
307 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.29 
 
 
313 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.62 
 
 
313 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  32.91 
 
 
312 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.3 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.3 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.3 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.42 
 
 
304 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.66 
 
 
315 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.4 
 
 
311 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.77 
 
 
304 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
306 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 
319 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 
319 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  34.62 
 
 
308 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  31.61 
 
 
328 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.94 
 
 
337 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.33 
 
 
315 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
322 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  34.6 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  34.1 
 
 
306 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  30.67 
 
 
308 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.48 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.51 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  29.61 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.39 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  31.11 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.43 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.73 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.78 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.85 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  30.3 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.66 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.21 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  33.33 
 
 
331 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.7 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.15 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  34.08 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.35 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.67 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  29.68 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  32.13 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.76 
 
 
312 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  29.87 
 
 
309 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.33 
 
 
308 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.89 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.33 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  30.77 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>