More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1534 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  56.41 
 
 
561 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  56.41 
 
 
583 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.86 
 
 
562 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.86 
 
 
562 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1189  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.12 
 
 
551 aa  634    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  56.41 
 
 
561 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.05 
 
 
561 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.73 
 
 
557 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.41 
 
 
583 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.05 
 
 
561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.91 
 
 
557 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.12 
 
 
558 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  55.28 
 
 
569 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  54.05 
 
 
569 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.16 
 
 
563 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  91.22 
 
 
586 aa  1113    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.87 
 
 
557 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.6 
 
 
573 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  54.68 
 
 
553 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  57.19 
 
 
553 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.41 
 
 
561 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.16 
 
 
563 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  65.36 
 
 
579 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  96.92 
 
 
584 aa  1158    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  78.05 
 
 
599 aa  944    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.05 
 
 
561 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.57 
 
 
590 aa  993    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2529  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  87.9 
 
 
590 aa  998    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  99.49 
 
 
584 aa  1199    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.41 
 
 
561 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.09 
 
 
557 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.05 
 
 
561 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  77.52 
 
 
601 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  76.7 
 
 
604 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.14 
 
 
557 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.99 
 
 
577 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.58 
 
 
561 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.19 
 
 
572 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.23 
 
 
572 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  94.86 
 
 
584 aa  1152    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.27 
 
 
555 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.41 
 
 
561 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.61 
 
 
560 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  56.29 
 
 
560 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
584 aa  1205    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  56.61 
 
 
569 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  56.68 
 
 
567 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.05 
 
 
561 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.45 
 
 
560 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.27 
 
 
557 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 
557 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 
557 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  62.09 
 
 
572 aa  714    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.775315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.91 
 
 
557 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.84 
 
 
557 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.38 
 
 
557 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  95.21 
 
 
584 aa  1157    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.07 
 
 
572 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.09 
 
 
557 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.27 
 
 
557 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
584 aa  1205    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.41 
 
 
561 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  64.82 
 
 
579 aa  757    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 
557 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.71 
 
 
566 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.48 
 
 
569 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  56.09 
 
 
558 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.64 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.82 
 
 
557 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.46 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.32 
 
 
569 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.64 
 
 
557 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.64 
 
 
557 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 
566 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.43 
 
 
560 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.32 
 
 
569 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.29 
 
 
557 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.1 
 
 
562 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.11 
 
 
557 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.71 
 
 
566 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.21 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  54.23 
 
 
552 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  52.96 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.04 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.04 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.83 
 
 
567 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.04 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.93 
 
 
562 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.31 
 
 
563 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.36 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.14 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  53.21 
 
 
556 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.93 
 
 
562 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>