138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1520 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 
301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 
301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 
301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  92.03 
 
 
300 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  63.52 
 
 
313 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.34 
 
 
301 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.67 
 
 
348 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  66.67 
 
 
299 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  66.34 
 
 
299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  66.34 
 
 
299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  66.34 
 
 
299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  66.34 
 
 
299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  66.34 
 
 
299 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  66.42 
 
 
311 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.55 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  51.85 
 
 
316 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  50.62 
 
 
316 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  39.82 
 
 
331 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  39.93 
 
 
318 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  40.21 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  40.21 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  37.82 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  36.12 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  34.59 
 
 
363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  31.85 
 
 
323 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  31.85 
 
 
323 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  45.58 
 
 
208 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  31 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  34.62 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  36.92 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  34.66 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  30.6 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  36.08 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  32.91 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  28.83 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  32.38 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  27.71 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.4 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  31.55 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  30.92 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  26.42 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.02 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.02 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.02 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  28.71 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  28.57 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  27 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.29 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.51 
 
 
281 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  26.51 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  27.9 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28.04 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  30.32 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  30.32 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  28.81 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  28.81 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  30 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  29.09 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  31.96 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  25.21 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.13 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  33.1 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  27.54 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.34 
 
 
233 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.35 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27.57 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  35.2 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  25.82 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  30.43 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  34.67 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  30.88 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  27.88 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  32.62 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.83 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  33.59 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.07 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  28.15 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.02 
 
 
288 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  28.18 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.28 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  36.13 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  35.25 
 
 
267 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  23.29 
 
 
292 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  28.69 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  27.92 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  28.37 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.89 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  29.01 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.12 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.01 
 
 
350 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  29.01 
 
 
350 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  29.01 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  29.01 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  25.74 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>