66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1518 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
164 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
164 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
164 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  90.85 
 
 
164 aa  295  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  57.86 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  58.94 
 
 
165 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  58.02 
 
 
166 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  52.26 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  53.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  53.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  53.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  53.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  53.61 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  53.01 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  53.61 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  52.41 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  50 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  42.48 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.59 
 
 
189 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  31.33 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 
181 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  41.18 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  37.27 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  31.78 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  41.46 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  42.5 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  37.97 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 
183 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  44.74 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  37.93 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  37.93 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  41.25 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  37.8 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  38.36 
 
 
190 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  35.23 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 
204 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  40 
 
 
179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 
179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.11 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  28.83 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  28.83 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  35.53 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  27.93 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  27.93 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  31.87 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  34.78 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  32.97 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  32.97 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  29.03 
 
 
274 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 
180 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  28.06 
 
 
264 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  27.03 
 
 
269 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  27.03 
 
 
269 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  40.62 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0364  leader peptidase TcpJ  28.12 
 
 
253 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.692702  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  40.62 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  40.62 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  42.22 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  29.73 
 
 
287 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  36.17 
 
 
289 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  32.58 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>