More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1149 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  99.63 
 
 
268 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  94.78 
 
 
268 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  94.4 
 
 
268 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  94.4 
 
 
268 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  90.3 
 
 
268 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  74.71 
 
 
275 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
273 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 
272 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  71.89 
 
 
263 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  72.65 
 
 
274 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  70.85 
 
 
270 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  68.4 
 
 
268 aa  361  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  70.45 
 
 
263 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  69.48 
 
 
263 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  67.34 
 
 
265 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  67.61 
 
 
258 aa  353  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  69.23 
 
 
263 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  67.08 
 
 
261 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  68.83 
 
 
263 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  67.5 
 
 
261 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
261 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 
261 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 
261 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  65.59 
 
 
261 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  65.59 
 
 
259 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  65.59 
 
 
259 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  63.35 
 
 
258 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  63.41 
 
 
260 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
260 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  62.95 
 
 
255 aa  330  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  61.38 
 
 
258 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  62.75 
 
 
284 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.07 
 
 
261 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.07 
 
 
261 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  57.75 
 
 
260 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  62.7 
 
 
255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
260 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
260 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
260 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 
260 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
267 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  61.42 
 
 
267 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  61.11 
 
 
266 aa  322  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  59.25 
 
 
270 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  57.36 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  57.92 
 
 
261 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 
269 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  56.85 
 
 
256 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 
267 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
284 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
271 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  59.02 
 
 
262 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  59.76 
 
 
263 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  59.26 
 
 
272 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  59.51 
 
 
258 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  57.84 
 
 
271 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  57.84 
 
 
271 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  58.54 
 
 
264 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  59.51 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  57.32 
 
 
254 aa  308  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  57.32 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 
269 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  57.36 
 
 
269 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  56.57 
 
 
269 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  56.91 
 
 
261 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  55.28 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  56.57 
 
 
269 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  56.11 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  58.2 
 
 
277 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  58.82 
 
 
274 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  54.47 
 
 
260 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 
271 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 
271 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
275 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
263 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  58.24 
 
 
271 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
258 aa  298  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  54.05 
 
 
267 aa  298  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>