More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1046 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  100 
 
 
228 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  100 
 
 
228 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  100 
 
 
228 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0926  cytidylate kinase  98.25 
 
 
228 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0922  cytidylate kinase  98.68 
 
 
228 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  99.12 
 
 
228 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2258  cytidylate kinase  97.81 
 
 
228 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179289  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  87.72 
 
 
228 aa  407  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  87.28 
 
 
255 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  86.84 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  87.05 
 
 
228 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  87.05 
 
 
228 aa  387  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  86.61 
 
 
228 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  70.42 
 
 
221 aa  281  8e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  69.48 
 
 
219 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  62.61 
 
 
231 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  62.61 
 
 
231 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  62.16 
 
 
230 aa  268  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1309  cytidylate kinase  62.09 
 
 
215 aa  238  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17223e-09 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0499  cytidylate kinase  62.91 
 
 
220 aa  238  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0933266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  59.91 
 
 
674 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  56.81 
 
 
226 aa  238  7e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.46962e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  56.81 
 
 
226 aa  238  7e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.97834e-08  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  59.62 
 
 
699 aa  234  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.9 
 
 
679 aa  234  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  62.26 
 
 
225 aa  233  1e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.42866e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.88 
 
 
670 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  58.99 
 
 
229 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.55 
 
 
668 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  56.19 
 
 
226 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  4.34199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.6 
 
 
673 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.6 
 
 
673 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  56.07 
 
 
225 aa  224  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1567  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.67 
 
 
669 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  54.13 
 
 
232 aa  222  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  53.7 
 
 
667 aa  222  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  55.19 
 
 
225 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  51.83 
 
 
226 aa  219  4e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.38917e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  50 
 
 
227 aa  218  8e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.25539e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.87427e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.20305e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  56.07 
 
 
705 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.00966e-08  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.88 
 
 
653 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.34482e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  2.77871e-05  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  55.5 
 
 
221 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.97985e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  4.59306e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  52.78 
 
 
227 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.47233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  55.61 
 
 
227 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  52.29 
 
 
226 aa  216  3e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  51.15 
 
 
229 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.09139e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  52.34 
 
 
229 aa  215  6e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.12654e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  51.39 
 
 
227 aa  215  6e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.49 
 
 
643 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  55.81 
 
 
675 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  7.06228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  52.31 
 
 
227 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  55.71 
 
 
228 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  49.54 
 
 
225 aa  213  1e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  50.47 
 
 
230 aa  213  2e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.98578e-06  hitchhiker  4.43143e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  55.4 
 
 
234 aa  213  2e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  53.21 
 
 
229 aa  213  2e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.36579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  51.38 
 
 
225 aa  213  2e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  55.71 
 
 
225 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  50.93 
 
 
230 aa  213  2e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.99193e-08  unclonable  9.55893e-11 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  49.55 
 
 
230 aa  213  3e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.68011e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1598  cytidylate kinase  55.14 
 
 
223 aa  213  3e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  50 
 
 
230 aa  213  3e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.46913e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  49.55 
 
 
230 aa  213  3e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.10063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  49.55 
 
 
230 aa  213  3e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.03512e-09  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  55.71 
 
 
228 aa  211  6e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  55.87 
 
 
228 aa  211  6e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1541  cytidylate kinase  54.67 
 
 
223 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  50.46 
 
 
224 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  50 
 
 
225 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.50284e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  50.92 
 
 
225 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.93863e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.69082e-07  unclonable  9.86897e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.05966e-09  unclonable  2.13103e-12 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  52.07 
 
 
229 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.9021e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  54.38 
 
 
224 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.22421e-08  unclonable  4.03388e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  208  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.66074e-05  hitchhiker  1.64919e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  49.54 
 
 
230 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.28627e-07  unclonable  2.41467e-05 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  52.58 
 
 
227 aa  207  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.1992e-05  hitchhiker  1.24191e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  53.27 
 
 
229 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.93328e-05  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  50.46 
 
 
226 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>