More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0920 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
314 aa  648  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  1.71601e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
314 aa  648  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  7.98578e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
313 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 
313 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
322 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 
313 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
350 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  1.01821e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.94465e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
294 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
294 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  30.8 
 
 
257 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  29.63 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.93 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 
259 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  29.36 
 
 
256 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  28.51 
 
 
256 aa  85.5  1e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  31.7 
 
 
327 aa  85.1  1e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 
254 aa  85.1  1e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
261 aa  85.1  1e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
256 aa  85.1  2e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
302 aa  85.1  2e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31 
 
 
290 aa  84  3e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  28.27 
 
 
263 aa  84  3e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
263 aa  83.6  4e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 
259 aa  83.6  4e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
299 aa  83.6  4e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.37624e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
259 aa  83.6  4e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 
259 aa  83.6  4e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.54 
 
 
259 aa  83.2  5e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
259 aa  83.2  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.54 
 
 
259 aa  83.2  5e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  26.71 
 
 
284 aa  83.2  6e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
257 aa  83.2  6e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
264 aa  82.4  1e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  30.21 
 
 
256 aa  81.6  1e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  29.88 
 
 
261 aa  82  1e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
330 aa  81.6  2e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.11 
 
 
319 aa  81.6  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.66 
 
 
277 aa  81.6  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  28.69 
 
 
257 aa  81.6  2e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.51 
 
 
256 aa  81.3  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
293 aa  80.9  3e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  28.09 
 
 
256 aa  80.9  3e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  31.22 
 
 
253 aa  80.9  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 
263 aa  80.9  3e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
253 aa  80.5  3e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
256 aa  80.5  3e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
287 aa  80.5  4e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  29.46 
 
 
253 aa  80.1  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
362 aa  80.1  4e-14  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.51 
 
 
256 aa  80.5  4e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.49 
 
 
273 aa  80.1  5e-14  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 
304 aa  80.1  5e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.49 
 
 
273 aa  80.1  5e-14  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
256 aa  79.7  6e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30.64 
 
 
265 aa  79.7  6e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
268 aa  79.7  6e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  28.1 
 
 
258 aa  79.3  8e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 
298 aa  79.3  8e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30.13 
 
 
254 aa  79  9e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.57 
 
 
260 aa  78.6  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
290 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
290 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
302 aa  79  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.49 
 
 
264 aa  79  1e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14742e-08 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
270 aa  79  1e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
279 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.38 
 
 
253 aa  79  1e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.72 
 
 
255 aa  77.8  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
261 aa  78.2  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
253 aa  78.2  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
303 aa  77.8  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
261 aa  78.2  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.41788e-05 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 
256 aa  78.2  2e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  3.86166e-07  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
337 aa  77.4  3e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
272 aa  77.4  3e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
254 aa  77.4  3e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 
295 aa  77.4  3e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  25.52 
 
 
261 aa  76.6  4e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  28.09 
 
 
257 aa  76.6  5e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.24 
 
 
257 aa  76.6  5e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.36624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
293 aa  76.6  5e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>