More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0826 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
327 aa  660  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
327 aa  660  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  98.78 
 
 
325 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  94.8 
 
 
327 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  85.63 
 
 
328 aa  561  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  86.85 
 
 
328 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  80.73 
 
 
327 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  5.35454e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.34216e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  1.21317e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.14793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
326 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  5.29291e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 
326 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  4.1163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2696  LysR family transcriptional regulator  62.28 
 
 
288 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
312 aa  234  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 
298 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  38.67 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
351 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
362 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
349 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
349 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
349 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
349 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 
367 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 
367 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
349 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
349 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 
349 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
355 aa  199  4e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0104  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
314 aa  195  8e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  36.47 
 
 
353 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 
312 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  36.05 
 
 
312 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
295 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 
312 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
295 aa  185  1e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
295 aa  184  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4973  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
306 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 
293 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
312 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.39 
 
 
305 aa  180  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 
312 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
571 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  36.99 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.35562e-05  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
313 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
313 aa  175  1e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
313 aa  175  1e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3766  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
306 aa  173  3e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
313 aa  174  3e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
313 aa  174  3e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
313 aa  174  3e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36.91 
 
 
293 aa  173  3e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
313 aa  174  3e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2342  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
306 aa  173  3e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
317 aa  173  4e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 
323 aa  173  4e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
316 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
316 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
313 aa  172  6e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
316 aa  172  6e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
296 aa  172  6e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
312 aa  172  7e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  35.74 
 
 
355 aa  172  7e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
309 aa  172  8e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4606  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
306 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3757  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
306 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 
311 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
303 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
315 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
313 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
294 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
294 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 
299 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3634  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
313 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 
304 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
294 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
294 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>