51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0801 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  99.72 
 
 
351 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  100 
 
 
351 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  100 
 
 
351 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  96.87 
 
 
351 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  88.89 
 
 
350 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  80.06 
 
 
355 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  79.49 
 
 
355 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  64.83 
 
 
334 aa  288  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  66.09 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  65.8 
 
 
341 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  53.33 
 
 
347 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  39.67 
 
 
342 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  37.54 
 
 
360 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  60.63 
 
 
351 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  31.56 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  57.02 
 
 
344 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.33 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  40.28 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  33.88 
 
 
351 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  30.29 
 
 
317 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  53.47 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.89 
 
 
302 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  29.19 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  32.56 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  39.32 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  39.32 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  48.57 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  38.32 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  41.86 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  29.95 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  30.52 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  28.68 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.36 
 
 
3242 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  43.1 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 
925 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  29.2 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  31 
 
 
332 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  40 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  39.06 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  34.94 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  35.34 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  39.74 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  33.85 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  30.82 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44478  predicted protein  32.34 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  57.5 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>