36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0797 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  81.13 
 
 		 106 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  49.45 
 
 		 173 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.62 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  40.54 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  60.34 
 
 		 227 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3181  transcriptional regulator, putative  54.69 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.53 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2898  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.89 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.294834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  41.41 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  32.71 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1700  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2265  hypothetical protein  39.68 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>