More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0774 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  844    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  844    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  53.44 
 
 
1147 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 
1303 aa  302  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
1301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
1239 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
1220 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
1292 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.52 
 
 
1867 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 
1265 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
1271 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  32.58 
 
 
1608 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
924 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
539 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
441 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  23.08 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  25.76 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
413 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  23.62 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.85 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
733 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.82 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.53 
 
 
775 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  22.84 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.6 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  24.6 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  32.08 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  33.59 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  24.11 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  24.14 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.09 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.42 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  33.63 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.13 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
417 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.21 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  22.77 
 
 
488 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
349 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  24.47 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  43.59 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.87 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  31.71 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
355 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
354 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.88 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
358 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
354 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
364 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.11 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>