More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0369 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  1.54943e-11 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 
72 aa  147  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 
72 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 
72 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  97.22 
 
 
72 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04255e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 
72 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 
72 aa  144  4e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  141  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  139  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.94229e-10  hitchhiker  1.61331e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  138  2e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0074  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  139  2e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  8.45588e-10 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  134  6e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0340  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  126  8e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000179995  unclonable  3.53194e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0349  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0489809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0519  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159478  unclonable  1.36175e-11 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  120  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  4e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  117  5e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.63825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  5e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  5e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  1e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.50237e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.58057e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.07147e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.33006e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
83 aa  115  2e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
73 aa  115  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.8053e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.40297e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.16088e-07  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.41165e-09  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.18565e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.2982e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  2e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  115  2e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
83 aa  115  2e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.21348e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01127e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.28096e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0744  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.85401e-05  hitchhiker  1.21311e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.77082e-10  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.90707e-07  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
72 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  4e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  4e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  4e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>