More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0247 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  100 
 
 
274 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  100 
 
 
274 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  100 
 
 
274 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  94.83 
 
 
291 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  94.83 
 
 
277 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  93.43 
 
 
274 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  94.42 
 
 
273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  84.87 
 
 
291 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  83.03 
 
 
273 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  83.03 
 
 
273 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  83.03 
 
 
273 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  83.03 
 
 
273 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  83.39 
 
 
273 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  83.39 
 
 
273 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  82.66 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  77.66 
 
 
273 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  76.92 
 
 
273 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  73.63 
 
 
273 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  43.94 
 
 
266 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  41.67 
 
 
275 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  42.48 
 
 
266 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  39.92 
 
 
274 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  40.6 
 
 
266 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  40.98 
 
 
269 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  38.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  40.98 
 
 
269 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  40.98 
 
 
269 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  40.6 
 
 
266 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  40 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 
266 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 
266 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 
266 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  39.85 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  39.85 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
266 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  36.82 
 
 
263 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  36.36 
 
 
266 aa  175  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  35.25 
 
 
272 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  35.25 
 
 
272 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  34.87 
 
 
272 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  36.23 
 
 
272 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  36.23 
 
 
272 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  35.63 
 
 
272 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  35.85 
 
 
272 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  35.47 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  34.72 
 
 
272 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
273 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  33.84 
 
 
274 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  34.46 
 
 
273 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  34.46 
 
 
273 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  34.17 
 
 
255 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
265 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
262 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
269 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.77 
 
 
265 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.9 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
269 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 
267 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
262 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
268 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  29.74 
 
 
268 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.91 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.3 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  30.04 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  31.58 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.69 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
270 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.69 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  28.15 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  27.3 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  28.03 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  89  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
267 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.73 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.68 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>