More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0238 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  48.31 
 
 
821 aa  741  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  88.87 
 
 
779 aa  1417  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  48.57 
 
 
821 aa  744  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  48.31 
 
 
776 aa  741  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.55 
 
 
790 aa  783  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 
776 aa  744  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 
776 aa  745  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
780 aa  1593  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  48.31 
 
 
776 aa  741  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
780 aa  1593  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  56.28 
 
 
781 aa  854  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  48.31 
 
 
776 aa  741  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  47.52 
 
 
797 aa  730  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  50.07 
 
 
790 aa  771  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
1143 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  33.16 
 
 
1116 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 
1144 aa  317  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.1 
 
 
585 aa  311  3e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
974 aa  308  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
633 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
789 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.15 
 
 
1106 aa  293  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
627 aa  284  5e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
732 aa  284  5e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
619 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
828 aa  277  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
717 aa  277  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
598 aa  276  1e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
828 aa  276  1e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
822 aa  275  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
828 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 
699 aa  274  4e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
717 aa  273  8e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
1106 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.7 
 
 
589 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
708 aa  271  3e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
1714 aa  271  3e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
824 aa  270  6e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
754 aa  270  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.66 
 
 
529 aa  269  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
713 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
754 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
595 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
626 aa  266  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
589 aa  263  7e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 
667 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 
715 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.96 
 
 
723 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
734 aa  261  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
833 aa  261  5e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
968 aa  255  2e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
789 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
647 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
796 aa  244  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.93 
 
 
937 aa  243  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.7 
 
 
1221 aa  243  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.66 
 
 
739 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.66 
 
 
921 aa  241  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.83 
 
 
553 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
693 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  28.83 
 
 
1415 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 
739 aa  225  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.88 
 
 
708 aa  224  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.33 
 
 
739 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
727 aa  217  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.02 
 
 
596 aa  215  2e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
1085 aa  214  5e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
552 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
718 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.27 
 
 
816 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
633 aa  203  1e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.17 
 
 
740 aa  186  1e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
739 aa  185  2e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.6 
 
 
742 aa  184  5e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
909 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
750 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
733 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
808 aa  181  5e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1094 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
4489 aa  179  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
3560 aa  176  1e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
672 aa  176  1e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 
570 aa  176  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
618 aa  175  3e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  28.36 
 
 
568 aa  174  4e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
654 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
740 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
700 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
667 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
3035 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
632 aa  166  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
811 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
761 aa  162  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.9 
 
 
633 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
647 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 
560 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
616 aa  157  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
574 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.04 
 
 
630 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
611 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>