13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0216 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0216  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2890  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0247  hypothetical protein  49.56 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6961  hypothetical protein  49.04 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5920  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.049411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0019  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0020  hypothetical protein  44.76 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3868  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4833  hypothetical protein  37.84 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4581  hypothetical protein  38.83 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3507  hypothetical protein  38.83 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.446944  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4591  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5463  hypothetical protein  48.39 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>