More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0177 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.33 
 
 
271 aa  241  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
265 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
257 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
264 aa  228  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
259 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 
259 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  45.86 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 
259 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 
257 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
261 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
268 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
249 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
249 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
249 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
257 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
273 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
266 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.02 
 
 
260 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 
263 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
256 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
270 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
258 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.47 
 
 
297 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
261 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  39.47 
 
 
297 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  39.47 
 
 
261 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.47 
 
 
261 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  39.47 
 
 
261 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
257 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.47 
 
 
297 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
255 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
255 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
255 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  39.1 
 
 
261 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
269 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
257 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
797 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.35 
 
 
261 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
260 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
266 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
254 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  39.1 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
264 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  37.97 
 
 
264 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
253 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.72 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
266 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
256 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
253 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
254 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
261 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  35.96 
 
 
260 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.8 
 
 
260 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.25 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
269 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.25 
 
 
260 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
260 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
265 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
255 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
260 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
285 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.78 
 
 
255 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
260 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  36.36 
 
 
260 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
254 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.78 
 
 
255 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
261 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
247 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
247 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
247 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.07 
 
 
260 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  38.58 
 
 
262 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>