109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0078 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 
320 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 
320 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  99.38 
 
 
320 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  97.03 
 
 
306 aa  593  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  94.75 
 
 
308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  93.44 
 
 
308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  92.13 
 
 
324 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  84.85 
 
 
297 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  81.19 
 
 
336 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  80.88 
 
 
336 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  86.2 
 
 
297 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  86.2 
 
 
297 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  86.2 
 
 
297 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  86.2 
 
 
297 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  86.2 
 
 
297 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  73.65 
 
 
336 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  76.35 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  62.29 
 
 
310 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  64.21 
 
 
313 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  61.62 
 
 
316 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  63.18 
 
 
314 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  63.18 
 
 
314 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  59.34 
 
 
296 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  59.71 
 
 
297 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  55.64 
 
 
299 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  54.35 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  57.04 
 
 
289 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  56.67 
 
 
303 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  55.43 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  52.96 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  52.75 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  55.73 
 
 
292 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  53.21 
 
 
292 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  53.94 
 
 
279 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  53.94 
 
 
279 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  51.14 
 
 
295 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  53.12 
 
 
296 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  51.78 
 
 
275 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  49.81 
 
 
312 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  48.99 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  45.91 
 
 
266 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  46.69 
 
 
271 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  48.02 
 
 
271 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  46.15 
 
 
271 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  49.12 
 
 
266 aa  229  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  44.75 
 
 
266 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  44.75 
 
 
266 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  48.05 
 
 
261 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  44.75 
 
 
266 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  46.28 
 
 
271 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  47.35 
 
 
262 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  46.78 
 
 
265 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  44.73 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  44.73 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  44.73 
 
 
262 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  47.37 
 
 
244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  45.83 
 
 
290 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 
261 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  45.06 
 
 
263 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  45.26 
 
 
262 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 
265 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  44.4 
 
 
262 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  46.06 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 
266 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  45.04 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  42.98 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  46.32 
 
 
277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  44.21 
 
 
264 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  43.78 
 
 
264 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  42.19 
 
 
271 aa  208  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  48.23 
 
 
263 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  42.79 
 
 
267 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  41.63 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  40.39 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  44.05 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  40.56 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  41.13 
 
 
250 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  43.86 
 
 
265 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 
265 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  38.93 
 
 
263 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  38.93 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  34.4 
 
 
246 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  40.17 
 
 
243 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  35.9 
 
 
247 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  28.62 
 
 
585 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  29.2 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  28.78 
 
 
584 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  28.78 
 
 
584 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  29.2 
 
 
584 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  31.54 
 
 
529 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  31.54 
 
 
529 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  28.41 
 
 
584 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  28.41 
 
 
584 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  28.04 
 
 
584 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  28.41 
 
 
584 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  28.41 
 
 
584 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  31.18 
 
 
529 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  28.47 
 
 
584 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  29.43 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>