94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0045 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  99.22 
 
 		 128 aa  253  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  61.72 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  57.03 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  57.03 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  55.2 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  53.91 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  58.33 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  55.05 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  55 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  50 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  45.08 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  45.08 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  48.8 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  45.97 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  46.4 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  45.97 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  47.93 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  47.15 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  47.97 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  47.15 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  42.15 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  44.72 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  41.67 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  40.5 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  37.3 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  41.27 
 
 		 128 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  41.86 
 
 		 128 aa  87  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  43.8 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  42.98 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  41.27 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  39.02 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  40.5 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  34.43 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  41.32 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  41.6 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  40.8 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  43.2 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  39.02 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  44.44 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  31.15 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  39.02 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  35.59 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  35.25 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  40.98 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  54.41 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  34.75 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  36.07 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  36.8 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  38.84 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  35.65 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  35.48 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  37.98 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  35.04 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  33.62 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  47.17 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  33.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  33.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  27.64 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  45.83 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2182  hypothetical protein  48.78 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.931178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  26.4 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  25.41 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>