131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0023 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0047  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0023  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0041  hypothetical protein  98.22 
 
 
337 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0016  hypothetical protein  95.25 
 
 
337 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0023  hypothetical protein  94.96 
 
 
337 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3208  hypothetical protein  93.18 
 
 
337 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0024  hypothetical protein  89.02 
 
 
337 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1051  IMP dehydrogenase/GMP reductase  69.77 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0965  hypothetical protein  69.77 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2289  hypothetical protein  69.45 
 
 
324 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1712  hypothetical protein  68.17 
 
 
324 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3659  methyltransferase  64.17 
 
 
339 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1380  hypothetical protein  58.21 
 
 
336 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55895  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1310  hypothetical protein  53.55 
 
 
327 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1597  hypothetical protein  53.82 
 
 
323 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5395  hypothetical protein  54.63 
 
 
323 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.634547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1794  methyltransferase  54.6 
 
 
326 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1639  hypothetical protein  51.99 
 
 
321 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2028  hypothetical protein  49.39 
 
 
325 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1758  hypothetical protein  53.33 
 
 
323 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4562  hypothetical protein  51.76 
 
 
342 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6117  methyltransferase  50.31 
 
 
325 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3706  hypothetical protein  52.38 
 
 
323 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0355  methyltransferase  52.94 
 
 
330 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332858  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3264  hypothetical protein  47.56 
 
 
329 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2254  hypothetical protein  53.07 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.0124622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0783  hypothetical protein  51.91 
 
 
324 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3414  hypothetical protein  50.94 
 
 
325 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2792  hypothetical protein  48.25 
 
 
334 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2197  hypothetical protein  48.61 
 
 
326 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.486689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2422  hypothetical protein  49.84 
 
 
325 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0766899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3543  methyltransferase  50.81 
 
 
325 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510327  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4038  methyltransferase type 12  47.4 
 
 
320 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645243  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3219  hypothetical protein  50.49 
 
 
325 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  50.49 
 
 
723 aa  272  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1582  hypothetical protein  48.25 
 
 
348 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183608  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19130  hypothetical protein  47.87 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3536  hypothetical protein  43.77 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3927  hypothetical protein  48.52 
 
 
310 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0996  hypothetical protein  46.62 
 
 
326 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1610  hypothetical protein  45.7 
 
 
308 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2433  hypothetical protein  44.81 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3037  methyltransferase  48.28 
 
 
323 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3803  hypothetical protein  48.34 
 
 
310 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3076  hypothetical protein  48.83 
 
 
310 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3998  methyltransferase  47.12 
 
 
324 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477214  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4281  hypothetical protein  43.28 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.939851  normal  0.96303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3091  hypothetical protein  45.4 
 
 
312 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171526  normal  0.281911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2377  hypothetical protein  43.65 
 
 
314 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2568  hypothetical protein  44.21 
 
 
321 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.852734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2835  hypothetical protein  43.08 
 
 
318 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3088  hypothetical protein  44.26 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1925  hypothetical protein  42.53 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2684  methyltransferase  42.02 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2449  methyltransferase  45.82 
 
 
324 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.015103  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2462  hypothetical protein  42.58 
 
 
315 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4913  hypothetical protein  41.56 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  42.05 
 
 
766 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1408  hypothetical protein  45.82 
 
 
324 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2545  methyltransferase  45.82 
 
 
324 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0089  hypothetical protein  41.83 
 
 
324 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745723  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2909  hypothetical protein  43.51 
 
 
341 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2648  methyltransferase  46.49 
 
 
319 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.52749  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0149  methyltransferase  40.79 
 
 
339 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0176705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03587  hypothetical protein  42.04 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2473  hypothetical protein  47.62 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0784  hypothetical protein  44.77 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.775463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1318  hypothetical protein  43.24 
 
 
321 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2712  methyltransferase  41.8 
 
 
344 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0350955  normal  0.448618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3404  methyltransferase  41.8 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1020  hypothetical protein  45.73 
 
 
318 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497946  decreased coverage  0.00147567 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0653  hypothetical protein  37.34 
 
 
339 aa  215  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2288  hypothetical protein  42.69 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1586  methyltransferase  44.44 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1639  hypothetical protein  45.78 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2623  hypothetical protein  41.69 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13732  hypothetical protein  44.37 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0639669  normal  0.513162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0821  hypothetical protein  44.15 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0329  hypothetical protein  44.87 
 
 
326 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4835  hypothetical protein  41.53 
 
 
412 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0950  hypothetical protein  43.96 
 
 
366 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4879  hypothetical protein  43.24 
 
 
321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4968  hypothetical protein  43.24 
 
 
321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5247  hypothetical protein  43.24 
 
 
321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1660  hypothetical protein  37.62 
 
 
315 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3638  methyltransferase  43.99 
 
 
318 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0892  methyltransferase  42.81 
 
 
348 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.3838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2566  hypothetical protein  40.46 
 
 
362 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228529  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2116  hypothetical protein  43.51 
 
 
321 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3410  methyltransferase  37.83 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.613981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1724  hypothetical protein  42.41 
 
 
328 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2259  hypothetical protein  42.39 
 
 
321 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353181  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0941  methyltransferase  43 
 
 
341 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5483  hypothetical protein  43.24 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144167  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0640  methyltransferase  43.41 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0917  hypothetical protein  41.03 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3834  hypothetical protein  38.05 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0475363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1079  methyltransferase  44.16 
 
 
328 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0202  methyltransferase  42.62 
 
 
322 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1309  methyltransferase  40.07 
 
 
334 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.807704  normal  0.852602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>