170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0013 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0055  tRNA-Arg  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0046  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0031  tRNA-Arg  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.250775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0016  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0032  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0036  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08860  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00968271  normal  0.0225487 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02560  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.574761  hitchhiker  0.000017399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  86.76 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0009  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.184283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0441272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32790  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251285  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924826  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358997  normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14028  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.989e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>