48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4199 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
1278 aa  2538  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.44 
 
 
347 aa  132  5e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.45 
 
 
376 aa  114  1e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.16 
 
 
340 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.32 
 
 
628 aa  97.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 
466 aa  95.9  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 
316 aa  95.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.13 
 
 
350 aa  92.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.29 
 
 
517 aa  92.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.75 
 
 
607 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  30.43 
 
 
341 aa  91.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 
634 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.13 
 
 
355 aa  90.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 
634 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 
634 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  25.32 
 
 
344 aa  89.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  30.38 
 
 
340 aa  89.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  26.86 
 
 
627 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 
507 aa  89  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 
316 aa  87  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 
426 aa  86.7  3e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.66 
 
 
2073 aa  85.5  5e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 
355 aa  84.3  1e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.96 
 
 
316 aa  83.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.64 
 
 
316 aa  82  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.26 
 
 
648 aa  82  7e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.32 
 
 
316 aa  81.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.32 
 
 
316 aa  81.3  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  24.84 
 
 
316 aa  79.7  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 
349 aa  79.3  4e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
392 aa  76.3  4e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 
353 aa  76.3  4e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  24.27 
 
 
329 aa  76.3  4e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 
580 aa  75.5  7e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.69 
 
 
362 aa  74.3  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.45228e-11  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
502 aa  70.1  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.63 
 
 
378 aa  70.5  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.5 
 
 
315 aa  69.7  3e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.6 
 
 
378 aa  68.9  6e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
377 aa  67.4  1e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.48 
 
 
315 aa  67.4  2e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  23.74 
 
 
314 aa  65.9  4e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.74 
 
 
333 aa  65.9  5e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.74 
 
 
333 aa  65.9  5e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 
333 aa  65.1  8e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.94 
 
 
505 aa  61.2  1e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 
384 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 
315 aa  50.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>