More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4182 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.31 
 
 
890 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
836 aa  1675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.63 
 
 
764 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  47 
 
 
808 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  47.73 
 
 
803 aa  588  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  44.83 
 
 
825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  45.43 
 
 
859 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  48.83 
 
 
764 aa  534  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  45.02 
 
 
774 aa  495  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  42.3 
 
 
695 aa  482  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  42.97 
 
 
727 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.11 
 
 
1129 aa  382  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  39.02 
 
 
719 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
806 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
1245 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
806 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
806 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
778 aa  365  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  39.23 
 
 
1117 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  39.21 
 
 
1306 aa  361  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  37.42 
 
 
724 aa  357  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 
725 aa  357  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
747 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  37.92 
 
 
821 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  34.98 
 
 
822 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
1065 aa  348  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
815 aa  347  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
830 aa  343  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.1 
 
 
761 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  34.66 
 
 
961 aa  326  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 
950 aa  322  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.99 
 
 
814 aa  318  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  34.76 
 
 
978 aa  314  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.44 
 
 
776 aa  313  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  33.85 
 
 
752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 
712 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 
732 aa  303  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
820 aa  302  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 
735 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
975 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 
720 aa  299  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
979 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 
755 aa  298  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.07 
 
 
734 aa  298  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 
833 aa  297  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.92 
 
 
727 aa  296  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.01 
 
 
734 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.29 
 
 
710 aa  296  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 
714 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.76 
 
 
728 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.82 
 
 
739 aa  296  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.68 
 
 
741 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.42 
 
 
720 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 
727 aa  294  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
867 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 
704 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.89 
 
 
714 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.44 
 
 
784 aa  289  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 
728 aa  287  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.61 
 
 
712 aa  287  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.11 
 
 
649 aa  287  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.68 
 
 
710 aa  287  7e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.55 
 
 
801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 
643 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  33.47 
 
 
817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.07 
 
 
643 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.71 
 
 
640 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.07 
 
 
643 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.75 
 
 
770 aa  283  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 
723 aa  283  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.49 
 
 
833 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.77 
 
 
775 aa  280  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 
640 aa  280  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.63 
 
 
838 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  32.89 
 
 
750 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
769 aa  279  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 
648 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.79 
 
 
723 aa  277  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 
618 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 
811 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.92 
 
 
761 aa  274  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  33.79 
 
 
744 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  34.4 
 
 
712 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 
712 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.8 
 
 
654 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.26 
 
 
648 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
732 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 
779 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  31.31 
 
 
724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.56 
 
 
730 aa  268  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 
776 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 
676 aa  266  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 
763 aa  266  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 
654 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 
718 aa  265  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.39 
 
 
727 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.78 
 
 
658 aa  265  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.47 
 
 
824 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.21 
 
 
626 aa  265  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.7 
 
 
718 aa  265  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>