More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4178 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  100 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  66.9 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  64.14 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  62.76 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  61.38 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  65.75 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  57.93 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  58.5 
 
 		 148 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  59.72 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  56.55 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  57.93 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  60.81 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  54.05 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  54.48 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  54.48 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  57.43 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  55.86 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  53.1 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  55.78 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  54.17 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  58.5 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  52.08 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  53.79 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  55.17 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  50.68 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.83 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  47.01 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.28 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  44.29 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  37.32 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.47 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 171 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  33.57 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 189 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.42 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  38 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 152 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>