More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4155 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  59.51 
 
 
261 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  59.48 
 
 
247 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  53.39 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  51.29 
 
 
277 aa  251  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  56.54 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  54.95 
 
 
223 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  54.55 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  54.5 
 
 
271 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  52 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  53.57 
 
 
204 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  45.88 
 
 
313 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  47.75 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45.05 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45.05 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  44.86 
 
 
216 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  42.29 
 
 
230 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  45.05 
 
 
216 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  45.6 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  43.81 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  40.51 
 
 
208 aa  165  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  40.19 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  40 
 
 
230 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  40 
 
 
230 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  39.18 
 
 
217 aa  161  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  43.02 
 
 
247 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  41.62 
 
 
233 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.31 
 
 
224 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  37.62 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  37.3 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  37.82 
 
 
211 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  37.82 
 
 
211 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  39.78 
 
 
212 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  31.3 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  31.3 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  39.25 
 
 
215 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  37.84 
 
 
210 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  38.17 
 
 
212 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  34.68 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  36.52 
 
 
267 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  36.27 
 
 
224 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  37.44 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  34.41 
 
 
191 aa  121  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  31.89 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.94 
 
 
203 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  35.94 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.03 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  34.67 
 
 
705 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.67 
 
 
705 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  32.28 
 
 
362 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.27 
 
 
740 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36 
 
 
736 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2255  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.82 
 
 
769 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.3559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.04 
 
 
705 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3877  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.19 
 
 
742 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.91 
 
 
717 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1990  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
707 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1985  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
707 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  30.14 
 
 
359 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  30.15 
 
 
750 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 
570 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  30.15 
 
 
750 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2968  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.54 
 
 
760 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.5 
 
 
743 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1922  RelA/SpoT protein  36.55 
 
 
774 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2608  (p)ppGpp synthetase I  32.92 
 
 
761 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0347856  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3196  RelA/SpoT family protein  32.5 
 
 
743 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0189864  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2647  RelA/SpoT family protein  33.54 
 
 
762 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0342541  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  33.33 
 
 
774 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0033  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.08 
 
 
737 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0805282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  26.9 
 
 
366 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.66 
 
 
745 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  27.59 
 
 
388 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3258  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.45 
 
 
720 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  37.04 
 
 
722 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3950  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 
700 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02364  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  30.95 
 
 
712 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4147  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 
700 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0409  guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase  34.55 
 
 
707 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0259018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1778  GTP pyrophosphokinase  34.55 
 
 
707 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0230346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.09 
 
 
820 aa  55.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 
753 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00155  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/guanosine-3,5-bis pyrophosphate 3-pyrophosphohydrolase  31.06 
 
 
703 aa  55.8  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  29.05 
 
 
356 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  29.05 
 
 
356 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>