145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4154 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  64.19 
 
 
710 aa  774    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  72.6 
 
 
716 aa  1013    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  73.14 
 
 
715 aa  1032    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  72.2 
 
 
717 aa  1001    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  72.33 
 
 
715 aa  1029    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  56.06 
 
 
728 aa  704    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 
742 aa  1464    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  61.13 
 
 
764 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  67.38 
 
 
732 aa  897    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.09 
 
 
733 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.99 
 
 
741 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.93 
 
 
759 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  36.83 
 
 
724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  36.83 
 
 
724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.97 
 
 
724 aa  311  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  35.83 
 
 
754 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.75 
 
 
735 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.4 
 
 
766 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.56 
 
 
732 aa  300  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  35.47 
 
 
776 aa  300  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.85 
 
 
746 aa  300  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.48 
 
 
734 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.96 
 
 
726 aa  299  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.95 
 
 
742 aa  296  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.23 
 
 
813 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.53 
 
 
767 aa  293  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  36.77 
 
 
765 aa  293  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.86 
 
 
786 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.33 
 
 
758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.99 
 
 
804 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.57 
 
 
832 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.48 
 
 
742 aa  279  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.29 
 
 
748 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.62 
 
 
759 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.22 
 
 
758 aa  276  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.5 
 
 
685 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.38 
 
 
757 aa  259  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  33.98 
 
 
795 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  39.1 
 
 
750 aa  258  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.42 
 
 
829 aa  257  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  32.52 
 
 
902 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.08 
 
 
771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.94 
 
 
788 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.22 
 
 
691 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.82 
 
 
747 aa  241  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.49 
 
 
693 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.52 
 
 
672 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  34.95 
 
 
874 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.39 
 
 
703 aa  220  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  31.31 
 
 
706 aa  217  7e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.07 
 
 
659 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  30.76 
 
 
799 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  31.4 
 
 
705 aa  207  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  29.4 
 
 
792 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  27.56 
 
 
680 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.02 
 
 
724 aa  167  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.75 
 
 
695 aa  164  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  29.01 
 
 
727 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.31 
 
 
705 aa  162  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  38.46 
 
 
726 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  40.3 
 
 
706 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  38.79 
 
 
666 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  40.42 
 
 
684 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  38.68 
 
 
719 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.6 
 
 
679 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  37.55 
 
 
692 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.22 
 
 
645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  34.3 
 
 
761 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.75 
 
 
670 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  37.39 
 
 
695 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  35.6 
 
 
717 aa  138  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.13 
 
 
710 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  35.9 
 
 
1048 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  23.66 
 
 
706 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  26.07 
 
 
706 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.03 
 
 
763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.03 
 
 
763 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.06 
 
 
861 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.23 
 
 
755 aa  110  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  29.21 
 
 
755 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  32.34 
 
 
748 aa  107  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 
780 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.67 
 
 
753 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.04 
 
 
706 aa  104  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  31.36 
 
 
776 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  31.36 
 
 
776 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  31.76 
 
 
778 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  31.36 
 
 
776 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.93 
 
 
776 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.93 
 
 
777 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.29 
 
 
716 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  30.93 
 
 
777 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  30.27 
 
 
691 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  30.08 
 
 
689 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  30.08 
 
 
691 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  30.93 
 
 
777 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  30.08 
 
 
689 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  30.08 
 
 
689 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  30.27 
 
 
691 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  30.08 
 
 
689 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>