214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4120 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  83.04 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  64.4 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 296 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  64.14 
 
 		 305 aa  341  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 299 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  61.36 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  59.06 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  60.55 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  60.68 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  59.93 
 
 		 293 aa  324  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  59.39 
 
 		 293 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  58.11 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  57 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  57 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  56.81 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  56.01 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  56.89 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  54.33 
 
 		 290 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  56.7 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  50.65 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  53.74 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  52.78 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  52.8 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  48.76 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  47.35 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  48.81 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  47.42 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  49.82 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  44.85 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  45.55 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  45.45 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  43.62 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  46.76 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  42.61 
 
 		 276 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  43.11 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  41.44 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  43.73 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  46.29 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  43.92 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  39.93 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  42.18 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  44.19 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  40.29 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.76 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  40.27 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.72 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  37.72 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  41.7 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  40.21 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  40.21 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.22 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.54 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  41.49 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  39.62 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.73 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.08 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.21 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  42.09 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.16 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.19 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 284 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.79 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  37.63 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.54 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>