More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4094 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 317 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  60.39 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  53.27 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.87 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  43.39 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  40.67 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  43.09 
 
 		 291 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.17 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  32.79 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  38.64 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  45.15 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  40.74 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  40.74 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  37.19 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  39.39 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.28 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  38.14 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.56 
 
 		 287 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.56 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  42.6 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  41.81 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  35.79 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.37 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  33.45 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  34.18 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  34.18 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  34.42 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  33.45 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  33.92 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  34.32 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  34.32 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  30.56 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  30.43 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  30.54 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  29.29 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  29.74 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  32.34 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.18 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.65 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  28.53 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  27.96 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.55 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.81 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.26 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.02 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  39.58 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.3 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  27.55 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.33 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.61 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.63 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.33 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.26 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  30.92 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.07 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  28.97 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  26.37 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  22.15 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  29.54 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.74 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>