41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4067 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 		 160 aa  316  9e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  43.4 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  48.43 
 
 		 249 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  42.77 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  42.77 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  40.62 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  44.38 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  42.59 
 
 		 165 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  43.75 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  30.91 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  33.59 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  34.16 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  34.16 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  30.16 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  30.16 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  33.12 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  32.48 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  26.54 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  34.59 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  28.07 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  36.51 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  29.88 
 
 		 232 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  31.29 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  26.35 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  29.68 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  30.46 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  32.48 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  29.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  27.48 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  32.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  27.16 
 
 		 179 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  30.72 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  29.45 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0854213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>