More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4037 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  100 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  63.35 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  60.81 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  60 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  56.42 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  57.41 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  54.05 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  50.9 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  43.3 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  44 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  35.27 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  41.78 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.56 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.8 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.86 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.74 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.57 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.23 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.56 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.41 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  34.68 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.35 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.15 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  35.71 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.36 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.57 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.64 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.09 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 337 aa  99  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.98 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.65 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36.59 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  29.44 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  33.18 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  30.32 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  38.5 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.74 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.34 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.61 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.6 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 268 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  29.55 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  29.55 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>