124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3955 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  100 
 
 
722 aa  1396    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  51.47 
 
 
708 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  56.84 
 
 
683 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  46.58 
 
 
718 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  49.77 
 
 
687 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  48.37 
 
 
718 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  49.58 
 
 
711 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  47.51 
 
 
697 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  44.53 
 
 
752 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  43.83 
 
 
708 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  39.54 
 
 
739 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  42.02 
 
 
631 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  42.02 
 
 
678 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  39.68 
 
 
651 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  42.06 
 
 
681 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  40.71 
 
 
664 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  40.41 
 
 
687 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.55 
 
 
675 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.24 
 
 
731 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  39.09 
 
 
692 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  39.18 
 
 
665 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  39.02 
 
 
665 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  39.02 
 
 
665 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  39.85 
 
 
691 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  40.69 
 
 
671 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  45.29 
 
 
686 aa  357  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  45.66 
 
 
651 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  45.66 
 
 
679 aa  337  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  40.17 
 
 
719 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.91 
 
 
736 aa  323  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  44.96 
 
 
672 aa  321  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  38.73 
 
 
676 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  37.46 
 
 
653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  32.41 
 
 
646 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  35.94 
 
 
641 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  35.94 
 
 
641 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  36.02 
 
 
637 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.89 
 
 
319 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  40.4 
 
 
310 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.96 
 
 
654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  36.63 
 
 
651 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  39.88 
 
 
319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  42.44 
 
 
322 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  41.37 
 
 
328 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  40.77 
 
 
322 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  36.3 
 
 
331 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  36.69 
 
 
331 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  36.69 
 
 
326 aa  147  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  36.69 
 
 
331 aa  147  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  35.87 
 
 
322 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  36.59 
 
 
308 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.99 
 
 
613 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.49 
 
 
604 aa  117  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.13 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.68 
 
 
394 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.7 
 
 
354 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  32.31 
 
 
387 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.27 
 
 
326 aa  99  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  35.02 
 
 
273 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  33.7 
 
 
254 aa  91.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.99 
 
 
277 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.99 
 
 
277 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  29.46 
 
 
265 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  27.84 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  27.61 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  29.07 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  31.71 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  28.06 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.87 
 
 
343 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  30.36 
 
 
270 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 
613 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  36.04 
 
 
339 aa  64.3  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.57 
 
 
571 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.12 
 
 
291 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.29 
 
 
246 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  32.04 
 
 
277 aa  62  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.71 
 
 
309 aa  61.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.36 
 
 
322 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.33 
 
 
544 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.15 
 
 
547 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  29.55 
 
 
300 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  32 
 
 
528 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  28.11 
 
 
316 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  31.15 
 
 
549 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.33 
 
 
544 aa  55.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  30.33 
 
 
439 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  26.61 
 
 
328 aa  54.7  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.15 
 
 
544 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.15 
 
 
544 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  27.78 
 
 
343 aa  54.3  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  28.36 
 
 
332 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  30.17 
 
 
549 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.83 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.33 
 
 
547 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.51 
 
 
547 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.4 
 
 
264 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.02 
 
 
316 aa  51.6  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.24 
 
 
265 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 
663 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 
588 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>