48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3872 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3872  Heme oxygenase  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  normal  0.243926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2758  Heme oxygenase  51.94 
 
 
216 aa  208  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35580  heme oxygenase  51.83 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1054  Heme oxygenase  51.13 
 
 
222 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.623466  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2345  heme oxygenase (decyclizing)  45.93 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  43.93 
 
 
217 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0079  Heme oxygenase  40.28 
 
 
223 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2962  Heme oxygenase  38.24 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0441  Heme oxygenase  40.38 
 
 
235 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3241  Heme oxygenase  39.71 
 
 
217 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00174182  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3635  Heme oxygenase  36.45 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0335  Heme oxygenase (decyclizing)  37.75 
 
 
239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0979075  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1414  Heme oxygenase  35.78 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1380  Heme oxygenase  35.78 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1858  Heme oxygenase (decyclizing)  38.24 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4613  Heme oxygenase  39.91 
 
 
229 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  40.95 
 
 
215 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3827  Heme oxygenase  35.78 
 
 
237 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3085  Heme oxygenase  44.55 
 
 
214 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17151  Heme oxygenase  34.47 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.714978  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3984  Heme oxygenase (decyclizing)  40 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85445  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3767  Heme oxygenase  34.8 
 
 
238 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00293088  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0166  Heme oxygenase (decyclizing)  35.78 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2851  heme oxygenase  35.29 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0196  Heme oxygenase (decyclizing)  35.29 
 
 
243 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17811  Heme oxygenase  31.55 
 
 
236 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18031  Heme oxygenase  32.04 
 
 
236 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17861  Heme oxygenase  32.04 
 
 
236 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1686  Heme oxygenase  32.04 
 
 
236 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.454788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3739  Heme oxygenase (decyclizing)  38.1 
 
 
227 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0567134  hitchhiker  0.000363645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20441  Heme oxygenase  32.67 
 
 
235 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.810996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1169  Heme oxygenase  32.67 
 
 
235 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1727  Heme oxygenase  37.13 
 
 
220 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22411  Heme oxygenase  35.44 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08750  heme oxygenase  42.65 
 
 
223 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4780  Heme oxygenase  34.17 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6429  heme oxygenase  40.51 
 
 
202 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12588  predicted protein  35.61 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0098  Heme oxygenase  32.69 
 
 
256 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0101  Heme oxygenase  32.69 
 
 
256 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5902  predicted protein  35.27 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1310  Heme oxygenase (decyclizing)  37.17 
 
 
226 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2604  Heme oxygenase  33.5 
 
 
248 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3387  heme oxygenase  29.81 
 
 
224 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0203  heme oxygenase 2  25.96 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0205  heme oxygenase  25.96 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1431  Heme oxygenase  26.96 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385185  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01200  heme oxygenase 2, putative  34.21 
 
 
364 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>