More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3854 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  100 
 
 
706 aa  1399    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  77.91 
 
 
338 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  68.63 
 
 
336 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  69.25 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  63.47 
 
 
329 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  64.09 
 
 
329 aa  429  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  66.26 
 
 
388 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  66.46 
 
 
327 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1399  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  70.49 
 
 
395 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000136472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1381  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  69.2 
 
 
392 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.37 
 
 
329 aa  415  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  63.66 
 
 
353 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  64.51 
 
 
328 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.2 
 
 
330 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  63.25 
 
 
340 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  66.88 
 
 
335 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  65.07 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  62.96 
 
 
326 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  64.29 
 
 
324 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component alpha subunit  71.58 
 
 
384 aa  405  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0930634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  62.73 
 
 
327 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2097  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  70.76 
 
 
422 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  65 
 
 
343 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  62.65 
 
 
326 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  61.8 
 
 
326 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  60.31 
 
 
326 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  64.83 
 
 
357 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  62.23 
 
 
331 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  63.55 
 
 
327 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  62.04 
 
 
326 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  63.75 
 
 
345 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  60.92 
 
 
342 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  60.31 
 
 
335 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.8 
 
 
345 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  62.04 
 
 
357 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  56.11 
 
 
393 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  64.8 
 
 
308 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  59.08 
 
 
327 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3967  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  59.33 
 
 
411 aa  356  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0180  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  61.17 
 
 
405 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  59.66 
 
 
372 aa  348  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  55.42 
 
 
344 aa  346  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3382  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  61.02 
 
 
386 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000572984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4509  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  58.31 
 
 
398 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.751763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  37.37 
 
 
657 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3332  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component subunit alpha  56.9 
 
 
361 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  55.21 
 
 
348 aa  342  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35870  pyruvate dehydrogenase E1 component, alpha subunit  60.88 
 
 
385 aa  340  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6068  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, subunit alpha  54.18 
 
 
385 aa  340  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657889  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00410  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component alpha subunit  59.44 
 
 
378 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0109  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  55.88 
 
 
391 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0109  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  55.88 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0093  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  57.72 
 
 
375 aa  337  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0532075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3223  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  59.53 
 
 
373 aa  337  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  57.41 
 
 
325 aa  336  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  57.28 
 
 
349 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  57.28 
 
 
349 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  57.28 
 
 
349 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0328  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  57.04 
 
 
380 aa  333  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5417  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  57.88 
 
 
371 aa  333  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  55.59 
 
 
325 aa  333  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8974  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  56.23 
 
 
363 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  54.97 
 
 
329 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38860  pyruvate dehydrogenase E1 component, alpha subunit  55.67 
 
 
376 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.666608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4858  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  60.34 
 
 
412 aa  330  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  55.62 
 
 
351 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0058  pyruvate dehydrogenase  61.8 
 
 
399 aa  328  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  50.77 
 
 
354 aa  326  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7267  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  59.52 
 
 
359 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  53.47 
 
 
370 aa  324  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.05 
 
 
373 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  55.56 
 
 
330 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3818  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  53.69 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  51.35 
 
 
339 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  54.91 
 
 
334 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6983  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  53.36 
 
 
397 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  53.87 
 
 
334 aa  317  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4028  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  51.84 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  53.56 
 
 
334 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  30.51 
 
 
659 aa  313  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4288  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  56.8 
 
 
390 aa  312  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.304087  normal  0.0921978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5311  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  53.36 
 
 
426 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  51.93 
 
 
349 aa  310  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  30.76 
 
 
659 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02350  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component alpha subunit  53.2 
 
 
401 aa  310  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  33.43 
 
 
675 aa  306  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2499  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  58.87 
 
 
358 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2468  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  52.53 
 
 
393 aa  306  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.15 
 
 
324 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  52.81 
 
 
325 aa  300  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  48.76 
 
 
342 aa  297  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  29.99 
 
 
668 aa  296  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  32.57 
 
 
736 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  48.92 
 
 
324 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  48.92 
 
 
324 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  29.69 
 
 
659 aa  294  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.61 
 
 
324 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  47.52 
 
 
328 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  47.27 
 
 
346 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  34.03 
 
 
710 aa  286  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>