192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3736 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  100 
 
 
661 aa  1276    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  47.28 
 
 
627 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  54.41 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  65.5 
 
 
572 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  48.48 
 
 
561 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  47.74 
 
 
546 aa  193  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.71 
 
 
469 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  39.9 
 
 
408 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  43.21 
 
 
485 aa  126  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.49 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  39.88 
 
 
413 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.89 
 
 
432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  47.41 
 
 
620 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  36.23 
 
 
407 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  38.54 
 
 
418 aa  110  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  40.86 
 
 
417 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  28.23 
 
 
518 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  28.14 
 
 
513 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  40 
 
 
418 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  35.61 
 
 
494 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  27.77 
 
 
497 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  45.54 
 
 
526 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  35.53 
 
 
510 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  45.37 
 
 
505 aa  94.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  35.53 
 
 
508 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  36.69 
 
 
414 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  49.44 
 
 
464 aa  92  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  35.03 
 
 
511 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  30.13 
 
 
464 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  42.54 
 
 
414 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  35.97 
 
 
414 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  32.89 
 
 
391 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  34.01 
 
 
552 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  35.03 
 
 
508 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  33.98 
 
 
507 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  33.98 
 
 
507 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  33.8 
 
 
495 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  38.29 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  33.67 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  34.18 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  33.67 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  38.73 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  33.82 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  33.66 
 
 
507 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  39.34 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  33.82 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  36.03 
 
 
522 aa  83.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  33.33 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  33.33 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  31.03 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  36.24 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.9 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.33 
 
 
566 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  34.51 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  41.75 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.11 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  34.1 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  34.27 
 
 
538 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  34.27 
 
 
526 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.39 
 
 
531 aa  77  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  30.82 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  30.19 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  30.82 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  34.51 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  39.02 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  30.17 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  30.19 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  34.27 
 
 
577 aa  76.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.09 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  31.44 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  33.73 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.03 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  40.48 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  40.48 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  30.19 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.95 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  40.48 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  39.68 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  29.61 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  39.68 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  30.19 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  29.56 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  30.19 
 
 
492 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  39.68 
 
 
430 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  39.68 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  30.19 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.51 
 
 
558 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  33.77 
 
 
532 aa  73.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  29.56 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  30.19 
 
 
492 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  39.68 
 
 
430 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  30.19 
 
 
492 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  39.68 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  30.19 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  32.95 
 
 
580 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  34.97 
 
 
535 aa  73.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.42 
 
 
605 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  39.68 
 
 
426 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  41.58 
 
 
437 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>