More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3712 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 421 aa  832    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.75 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.78 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.17 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  33.45 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 428 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.13 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.77 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.89 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.87 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.07 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.61 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.48 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.51 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.53 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.74 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.91 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.09 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.09 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.84 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.89 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.43 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.52 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>