More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3702 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  66.13 
 
 
683 aa  827    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2043  small GTP-binding protein  55.06 
 
 
687 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.713225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  100 
 
 
687 aa  1334    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.34 
 
 
696 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.54 
 
 
695 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.39 
 
 
692 aa  498  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.47 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  38.72 
 
 
679 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.88 
 
 
690 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  40.74 
 
 
680 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  39.94 
 
 
683 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.72 
 
 
694 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  36.7 
 
 
695 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.88 
 
 
696 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.44 
 
 
691 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.88 
 
 
696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  38.06 
 
 
694 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  37.61 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  37.25 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.65 
 
 
673 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  37.39 
 
 
697 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.07 
 
 
683 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  37.32 
 
 
701 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  36.96 
 
 
697 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.97 
 
 
673 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.63 
 
 
686 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  36.23 
 
 
682 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  39.04 
 
 
691 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.03 
 
 
694 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.66 
 
 
688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  41.07 
 
 
708 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  36.88 
 
 
670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  35.76 
 
 
694 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  37.27 
 
 
701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.5 
 
 
682 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  41.03 
 
 
719 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.54 
 
 
667 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.71 
 
 
696 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.12 
 
 
692 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  38.84 
 
 
701 aa  439  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  41.53 
 
 
677 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  36.22 
 
 
683 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  37.05 
 
 
707 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  39.23 
 
 
719 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  38.74 
 
 
703 aa  436  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.87 
 
 
701 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  37.22 
 
 
707 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  37.66 
 
 
703 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  39.8 
 
 
701 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  35.99 
 
 
701 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.97 
 
 
685 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.48 
 
 
693 aa  420  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  37.65 
 
 
699 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  36.43 
 
 
701 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  37.26 
 
 
686 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  40.43 
 
 
714 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  35.19 
 
 
683 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  34.97 
 
 
697 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  36.7 
 
 
686 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  40.46 
 
 
710 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  38.25 
 
 
688 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  36.44 
 
 
681 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  34.21 
 
 
689 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  35.47 
 
 
690 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  33.48 
 
 
692 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.75 
 
 
692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.87 
 
 
689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  32.95 
 
 
704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  36.59 
 
 
685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  34.73 
 
 
690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.11 
 
 
692 aa  409  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  40.4 
 
 
713 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  40.4 
 
 
713 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  40.71 
 
 
717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  34.55 
 
 
695 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  40.4 
 
 
713 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  34.74 
 
 
697 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.91 
 
 
700 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  41.05 
 
 
770 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  32.94 
 
 
692 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  33.29 
 
 
704 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  33.77 
 
 
697 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  32.7 
 
 
691 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  33.63 
 
 
697 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.7 
 
 
692 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.33 
 
 
687 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  37.9 
 
 
688 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.28 
 
 
692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  34.16 
 
 
685 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  33.05 
 
 
704 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  33.19 
 
 
691 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  32.65 
 
 
689 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  33.63 
 
 
697 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  34.15 
 
 
699 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  32.26 
 
 
692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  32.85 
 
 
691 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  34.1 
 
 
699 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  34.94 
 
 
695 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  37.21 
 
 
687 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  40.92 
 
 
717 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>