152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3692 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 176 aa  348  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  49.11 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 204 aa  94  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  30.06 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  35.65 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  30.29 
 
 		 305 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  43.48 
 
 		 189 aa  84  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  44.9 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.54 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  39.25 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  36.57 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  27.16 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  33.98 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  35.51 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.72 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  37.21 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  31.3 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  39.32 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  47.62 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  30.81 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.79 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.12 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  30.82 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  31.29 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  32.8 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  29.3 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  24.46 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  29.94 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  32.54 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  33.13 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  28.16 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.95 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  29.09 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3907  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  27.11 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  35.65 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>