125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3634 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 382 aa  736    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  50.3 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  49.64 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  43.31 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  40.48 
 
 		 178 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  37.8 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  41.73 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  41.73 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.89 
 
 		 190 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.89 
 
 		 190 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  47.73 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  43.31 
 
 		 214 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  43.94 
 
 		 175 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  35.94 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  38.93 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  36.97 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  40.54 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34.29 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.53 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40.15 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  32.72 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  36.81 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.61 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  39.53 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.81 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.22 
 
 		 189 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  32.19 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  31.41 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.15 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  36.3 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  32.31 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  36.22 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.88 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.52 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  46.07 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.93 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  31.94 
 
 		 183 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.92 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  36.51 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  45.98 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.18 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.5 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 162 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  32.5 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  38.41 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02960  micrococcal nuclease-like nuclease  32.1 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.82 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  26.2 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  28.21 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  27.33 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  34.59 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.06 
 
 		 175 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.14 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.88 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.08 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.14 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.81 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.01 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  33.61 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  33.6 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.86 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  28.81 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.43 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.22 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.87 
 
 		 171 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.55 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.71 
 
 		 161 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.43 
 
 		 278 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  32.06 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  29.81 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  25.32 
 
 		 153 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  26.73 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  27.81 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.03 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.27 
 
 		 183 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  36.04 
 
 		 214 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.81 
 
 		 164 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.43 
 
 		 187 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.33 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.06 
 
 		 221 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25.4 
 
 		 199 aa  49.7  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  28.08 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  28.78 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  32.12 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.81 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 183 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  32.35 
 
 		 115 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  28.72 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.29 
 
 		 153 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>