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for query gene Bcav_3630 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  47.94 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.51 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  34.38 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
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NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  37.88 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 276 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
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NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 280 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
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