74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3624 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 388 aa  790    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  78.1 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  78.36 
 
 		 388 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  76.44 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  77.49 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  73.04 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  72.85 
 
 		 382 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  72.85 
 
 		 382 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  73.11 
 
 		 382 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  74.07 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  73.18 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  72.51 
 
 		 392 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  73.7 
 
 		 392 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  71.8 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  69.71 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  71.28 
 
 		 390 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  54.74 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  55.12 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  54.4 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  54.72 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  50.27 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  51.19 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  49.07 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  55.27 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.53 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.68 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  42.48 
 
 		 430 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.56 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  43.08 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  41.78 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  41.24 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  42.04 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  40.72 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  40.05 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  40.99 
 
 		 429 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.47 
 
 		 424 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  41.27 
 
 		 430 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.53 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  39.69 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  29.73 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  25.52 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  26.51 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  29.65 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  31.58 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  28.8 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  28.57 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.27 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  29.69 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  29.2 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  28.57 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.79 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  29.02 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  27.24 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  27.59 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  27.32 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  28.57 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  28.29 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  29.35 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  26.61 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  23.9 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  27.17 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.63 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  27.75 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  28.1 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  27.78 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  21.15 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  26.22 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  27.05 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.48 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  24.63 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  27.09 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  28.1 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>