More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3600 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 433 aa  833    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.46 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.16 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.44 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.76 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.3 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.54 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.05 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.19 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.65 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.38 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.36 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.59 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.91 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.47 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.47 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.66 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.09 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  61.81 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.64 
 
 		 422 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.94 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.93 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  63 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.16 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.16 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.64 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.29 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.74 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  58 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.4 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.35 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.28 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.35 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.35 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.44 
 
 		 429 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.46 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.46 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.02 
 
 		 704 aa  342  8e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.32 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.44 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.73 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.41 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.78 
 
 		 419 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.9 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 425 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.52 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3104  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.63 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 420 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.39 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.25 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.4 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.99 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.36 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.37 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.94 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 420 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.91 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.14 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.87 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.28 
 
 		 429 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>