More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3547 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  49.81 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  43.24 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  31.6 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  29.84 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 278 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  33.19 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  30.22 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.78 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.36 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.57 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.33 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  32.26 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.22 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  33.49 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  32.41 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.71 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.29 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.09 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.12 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.68 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  31.75 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  30.53 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.44 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31.2 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.09 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  31.05 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.77 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.4 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>