More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3541 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  70.95 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.33 
 
 		 216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  70.95 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.88 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  65.69 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  61.95 
 
 		 207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.49 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.24 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.8 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.91 
 
 		 212 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 209 aa  211  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.04 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  55.39 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.15 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.41 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.1 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.41 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.53 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  49.52 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.26 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.07 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 234 aa  168  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  44.12 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.14 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.59 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  43.81 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.63 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  43.81 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 239 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  41.83 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>