More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3517 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 630 aa  1250    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  56.21 
 
 		 617 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  57.07 
 
 		 613 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  56.89 
 
 		 613 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  56.89 
 
 		 613 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  55.48 
 
 		 617 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  53.33 
 
 		 876 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  46.21 
 
 		 624 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  43.49 
 
 		 616 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  43.47 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  39.96 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  42.7 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  39.18 
 
 		 652 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  43.09 
 
 		 465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  41.55 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  43.43 
 
 		 426 aa  273  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  40.41 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.21 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  36.9 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  39.21 
 
 		 451 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  38.76 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  36.28 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  36.98 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38 
 
 		 450 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.63 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  38.42 
 
 		 453 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  38.18 
 
 		 453 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  40.7 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  36.89 
 
 		 439 aa  220  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  36.07 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.07 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.92 
 
 		 424 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  36.49 
 
 		 455 aa  217  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  37 
 
 		 456 aa  216  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  37 
 
 		 449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  36.26 
 
 		 423 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.34 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  33.64 
 
 		 475 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.56 
 
 		 394 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  34.68 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  33.49 
 
 		 450 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  34.43 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  38.96 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  33.69 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  35.63 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.43 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  34.47 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.73 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  35.63 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 389 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.51 
 
 		 392 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 430 aa  208  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.32 
 
 		 391 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.61 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  39.11 
 
 		 391 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  39.23 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.1 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.1 
 
 		 391 aa  205  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  35.37 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.83 
 
 		 396 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.07 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  37.26 
 
 		 401 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  35.82 
 
 		 457 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.31 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  38.92 
 
 		 392 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.95 
 
 		 398 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 427 aa  200  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.46 
 
 		 397 aa  200  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  38.96 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  34.38 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  35.5 
 
 		 453 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 399 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  36.66 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.82 
 
 		 436 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.43 
 
 		 391 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  34.79 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  35.89 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.08 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>