75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3446 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 537 aa  1086    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  62.72 
 
 		 538 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.09 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  58.63 
 
 		 532 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  56.92 
 
 		 527 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  53.9 
 
 		 595 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  54.66 
 
 		 568 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  57.17 
 
 		 532 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  58.24 
 
 		 530 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  57.49 
 
 		 531 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  52.37 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  50.94 
 
 		 619 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  50.89 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  42.59 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.55 
 
 		 660 aa  153  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 661 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  28.88 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  24.25 
 
 		 679 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.91 
 
 		 669 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  24.25 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.08 
 
 		 584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  28.21 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 676 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  29.67 
 
 		 599 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  24.48 
 
 		 675 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  24.81 
 
 		 692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.81 
 
 		 595 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  26.6 
 
 		 696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  26.13 
 
 		 696 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  28.16 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25 
 
 		 691 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  27.51 
 
 		 601 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  41.67 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  25.93 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.36 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  31.88 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.58 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.89 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  30.26 
 
 		 764 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  30.18 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.23 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.2 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.1 
 
 		 547 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 		 722 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  28.67 
 
 		 758 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  32.89 
 
 		 797 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  26.64 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  29.9 
 
 		 757 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.63 
 
 		 600 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.08 
 
 		 606 aa  50.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  35.65 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  27.21 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  25 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  32.98 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  21.35 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.88 
 
 		 600 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  31 
 
 		 445 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.7 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  32 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.45 
 
 		 764 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.28 
 
 		 706 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  26.42 
 
 		 668 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.13 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.32 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.65 
 
 		 459 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25.84 
 
 		 432 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  28.82 
 
 		 456 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  26.61 
 
 		 459 aa  43.5  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>