More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3375 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  100 
 
 		 580 aa  1103    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  64.41 
 
 		 575 aa  611  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  61.21 
 
 		 573 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  58.65 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  59.71 
 
 		 546 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  53.68 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  54.04 
 
 		 580 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  53.62 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  53.62 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  53.62 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  54.28 
 
 		 580 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  51.92 
 
 		 603 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  46.61 
 
 		 591 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  48.04 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  46.86 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  50.72 
 
 		 614 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  45.34 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  68.94 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  63.79 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  61.81 
 
 		 505 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 498 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  58.56 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  65.79 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  38.34 
 
 		 693 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  32.85 
 
 		 590 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  32.06 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  30.19 
 
 		 584 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  29.8 
 
 		 584 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.95 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  29.08 
 
 		 665 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  30.88 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.54 
 
 		 659 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  28.11 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  29.89 
 
 		 584 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  30.91 
 
 		 664 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  30.77 
 
 		 665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  29.95 
 
 		 571 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.97 
 
 		 518 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.03 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  32.11 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  29.64 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  28.86 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  28.7 
 
 		 572 aa  156  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  29.31 
 
 		 637 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  30.37 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  28.86 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  29.35 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  29.35 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  29.35 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  29.39 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.19 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  29.12 
 
 		 659 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  30.59 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.17 
 
 		 655 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  29.86 
 
 		 661 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  31.18 
 
 		 556 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  30.23 
 
 		 551 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  28.5 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  29.27 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  31.26 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 683 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.34 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  28.71 
 
 		 657 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.76 
 
 		 557 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  29.19 
 
 		 523 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.76 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  29.95 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  28.21 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.73 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  30.73 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  27.16 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  29.98 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 687 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.18 
 
 		 687 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  29.31 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  29.31 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  30.88 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 589 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  26.18 
 
 		 688 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  28.02 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  28.46 
 
 		 683 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  27.47 
 
 		 681 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 672 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.68 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  25.85 
 
 		 568 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 678 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  28.28 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  29.11 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  28.28 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  28.61 
 
 		 703 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  28.28 
 
 		 554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  28.28 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  39.63 
 
 		 513 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  29.31 
 
 		 614 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  28.36 
 
 		 553 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  30.06 
 
 		 564 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  28.42 
 
 		 699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>