More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3327 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  340  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  47.51 
 
 		 299 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  54.49 
 
 		 232 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 201 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  42.13 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 223 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 309 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.34 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 204 aa  97.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.46 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  33.52 
 
 		 231 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  43.65 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 250 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 266 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 223 aa  91.3  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 227 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  39.25 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  38.8 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 220 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.79 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>