More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3134 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  100 
 
 		 99 aa  198  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  82.11 
 
 		 100 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  83.52 
 
 		 90 aa  155  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  85.23 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  82.95 
 
 		 96 aa  150  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  79.57 
 
 		 98 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  81.11 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  76.34 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  75.82 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  77.42 
 
 		 93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  72.53 
 
 		 91 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  72.53 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  69.61 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  80.49 
 
 		 90 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  75.56 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  79.27 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  77.38 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  67.35 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  70 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  78.05 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  70.11 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  72.41 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  65.69 
 
 		 102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  64.65 
 
 		 99 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  71.59 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  73.81 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  74.39 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  71.11 
 
 		 94 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  64.65 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  64.65 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  75.61 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  64.65 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  69.41 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  68.54 
 
 		 93 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 93 aa  117  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  65.88 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  58.59 
 
 		 101 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 99 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  58.23 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  60.98 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  50.51 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  61.73 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  95.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>