More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3129 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  88.46 
 
 		 132 aa  239  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  87.69 
 
 		 132 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  86.92 
 
 		 132 aa  234  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  83.85 
 
 		 132 aa  228  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 132 aa  226  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  80.77 
 
 		 132 aa  224  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 132 aa  224  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  83.85 
 
 		 132 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  82.31 
 
 		 132 aa  223  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  79.23 
 
 		 132 aa  222  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  83.85 
 
 		 132 aa  222  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  83.85 
 
 		 132 aa  221  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  80 
 
 		 132 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  82.31 
 
 		 132 aa  221  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  79.23 
 
 		 132 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  80.77 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  80.77 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  80.77 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  79.23 
 
 		 132 aa  218  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  79.23 
 
 		 132 aa  217  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  80 
 
 		 132 aa  217  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  80 
 
 		 132 aa  215  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  79.23 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  78.2 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  79.1 
 
 		 136 aa  213  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  76.12 
 
 		 136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  76.15 
 
 		 132 aa  207  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  77.69 
 
 		 132 aa  207  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  73.68 
 
 		 134 aa  205  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  73.68 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  74.44 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  64.62 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  63.08 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  60.31 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  60.31 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  56.92 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  58.02 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  58.02 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  58.65 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  58.78 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>