More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3127 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  70.73 
 
 
123 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  69.11 
 
 
123 aa  166  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  70.8 
 
 
127 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  66.4 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  64.8 
 
 
127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  66.67 
 
 
123 aa  161  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  66.4 
 
 
123 aa  160  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  66.39 
 
 
124 aa  157  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  71.2 
 
 
123 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  65.62 
 
 
127 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  62.4 
 
 
122 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  63.25 
 
 
128 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  64.06 
 
 
127 aa  150  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  64.6 
 
 
126 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  64.8 
 
 
124 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  66.96 
 
 
134 aa  146  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  66.04 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  62.4 
 
 
124 aa  144  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  60.48 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  66.04 
 
 
134 aa  143  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  60.8 
 
 
127 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  61.29 
 
 
136 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  66.04 
 
 
127 aa  141  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  64.15 
 
 
131 aa  137  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  57.6 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  63.41 
 
 
123 aa  137  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  65.35 
 
 
127 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  66.67 
 
 
128 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  56.41 
 
 
121 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  63.81 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  63.81 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  63.81 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  58.87 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.64 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.86 
 
 
119 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
120 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
120 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  53.1 
 
 
118 aa  123  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
121 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 
120 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 
120 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 
119 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 
119 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  52.63 
 
 
124 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 
122 aa  119  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  51.28 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
121 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  51.38 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 
120 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 
120 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  50.91 
 
 
117 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
120 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  49.55 
 
 
116 aa  116  9e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  51.33 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  51.35 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  49.11 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  114  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.37 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  50.89 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  48.62 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  57.84 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  58.42 
 
 
120 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.25 
 
 
120 aa  114  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 
122 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  48.33 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  54 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  51.82 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
118 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  46.43 
 
 
122 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  54 
 
 
122 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  46.43 
 
 
122 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  54 
 
 
122 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  54.87 
 
 
120 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 
119 aa  110  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>