More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3072 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
160 aa  300  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  66.86 
 
 
196 aa  207  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  66.88 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  67.26 
 
 
184 aa  187  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  66.88 
 
 
153 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  61.31 
 
 
176 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  63.8 
 
 
179 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  61.54 
 
 
170 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  65.54 
 
 
163 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  65.64 
 
 
173 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  70.25 
 
 
170 aa  157  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  53.14 
 
 
211 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  63.7 
 
 
147 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  58.99 
 
 
165 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  47.16 
 
 
195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  50 
 
 
207 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  68.35 
 
 
148 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
205 aa  130  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  52.03 
 
 
157 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  57.24 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  60.58 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  61.49 
 
 
182 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  60.42 
 
 
178 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  56.16 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  62.1 
 
 
170 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.89 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  67.52 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  38.83 
 
 
188 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.74 
 
 
190 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  55.73 
 
 
154 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  45.89 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  40.85 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  63.93 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.67 
 
 
157 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.67 
 
 
157 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.54 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  63.64 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.67 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.67 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.41 
 
 
161 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  42.18 
 
 
150 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.33 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  44.92 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.67 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.33 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.24 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  42.22 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.33 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.74 
 
 
163 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  49.62 
 
 
168 aa  89  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  30.46 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  30.46 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40.4 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.33 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.9 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.9 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.06 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.23 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.73 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.61 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.85 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.54 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  55.56 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.64 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  42.65 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  39.07 
 
 
163 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  37.32 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.9 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.73 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  40.29 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  41.23 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  41.23 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  40.34 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  47.12 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  43.4 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  43.22 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.33 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  43.33 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  40.34 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  40.34 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  40.34 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  40.34 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  32.74 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  40.74 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>